Protein–RNA interactions for Protein: O60673

REV3L, DNA polymerase zeta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 3,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV3LO60673 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REV3LO60673 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REV3LO60673 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
REV3LO60673 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
REV3LO60673 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
REV3LO60673 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REV3LO60673 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REV3LO60673 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REV3LO60673 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REV3LO60673 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REV3LO60673 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REV3LO60673 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REV3LO60673 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REV3LO60673 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REV3LO60673 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REV3LO60673 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REV3LO60673 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
REV3LO60673 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REV3LO60673 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REV3LO60673 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REV3LO60673 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REV3LO60673 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REV3LO60673 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REV3LO60673 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REV3LO60673 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
REV3LO60673 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REV3LO60673 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REV3LO60673 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REV3LO60673 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REV3LO60673 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REV3LO60673 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REV3LO60673 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REV3LO60673 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REV3LO60673 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REV3LO60673 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REV3LO60673 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REV3LO60673 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REV3LO60673 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REV3LO60673 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REV3LO60673 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REV3LO60673 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REV3LO60673 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REV3LO60673 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REV3LO60673 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REV3LO60673 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
REV3LO60673 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
REV3LO60673 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REV3LO60673 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
REV3LO60673 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REV3LO60673 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REV3LO60673 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REV3LO60673 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REV3LO60673 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REV3LO60673 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REV3LO60673 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REV3LO60673 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REV3LO60673 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REV3LO60673 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REV3LO60673 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
REV3LO60673 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REV3LO60673 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
REV3LO60673 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REV3LO60673 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REV3LO60673 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REV3LO60673 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REV3LO60673 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REV3LO60673 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REV3LO60673 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REV3LO60673 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REV3LO60673 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REV3LO60673 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REV3LO60673 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REV3LO60673 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REV3LO60673 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms