Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL4O60488 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL4O60488 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL4O60488 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL4O60488 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL4O60488 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACSL4O60488 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL4O60488 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL4O60488 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL4O60488 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL4O60488 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL4O60488 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL4O60488 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL4O60488 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL4O60488 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL4O60488 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL4O60488 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL4O60488 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL4O60488 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL4O60488 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACSL4O60488 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSL4O60488 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACSL4O60488 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL4O60488 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms