Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMARCA5O60264 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCA5O60264 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms