Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC3O43617 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC3O43617 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC3O43617 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms