Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CLOCKO15516 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLOCKO15516 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms