Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAFD1O14545 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAFD1O14545 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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