Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CUX2O14529 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CUX2O14529 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CUX2O14529 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
CUX2O14529 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
CUX2O14529 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CUX2O14529 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CUX2O14529 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CUX2O14529 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CUX2O14529 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CUX2O14529 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CUX2O14529 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
CUX2O14529 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CUX2O14529 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CUX2O14529 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CUX2O14529 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CUX2O14529 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CUX2O14529 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CUX2O14529 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
CUX2O14529 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CUX2O14529 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CUX2O14529 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CUX2O14529 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CUX2O14529 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CUX2O14529 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CUX2O14529 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CUX2O14529 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CUX2O14529 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CUX2O14529 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CUX2O14529 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
CUX2O14529 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
CUX2O14529 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CUX2O14529 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CUX2O14529 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CUX2O14529 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CUX2O14529 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
CUX2O14529 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
CUX2O14529 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
CUX2O14529 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
CUX2O14529 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CUX2O14529 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CUX2O14529 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CUX2O14529 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CUX2O14529 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CUX2O14529 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CUX2O14529 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CUX2O14529 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CUX2O14529 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CUX2O14529 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CUX2O14529 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CUX2O14529 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CUX2O14529 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
CUX2O14529 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CUX2O14529 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CUX2O14529 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CUX2O14529 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CUX2O14529 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CUX2O14529 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
CUX2O14529 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CUX2O14529 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CUX2O14529 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CUX2O14529 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CUX2O14529 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CUX2O14529 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CUX2O14529 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CUX2O14529 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CUX2O14529 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
CUX2O14529 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CUX2O14529 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CUX2O14529 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CUX2O14529 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CUX2O14529 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CUX2O14529 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CUX2O14529 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CUX2O14529 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
CUX2O14529 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CUX2O14529 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CUX2O14529 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CUX2O14529 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
CUX2O14529 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CUX2O14529 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CUX2O14529 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CUX2O14529 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CUX2O14529 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
CUX2O14529 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
CUX2O14529 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC37.13■■■■□ 3.54
CUX2O14529 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.54
CUX2O14529 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC37.13■■■■□ 3.54
CUX2O14529 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
CUX2O14529 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CUX2O14529 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CUX2O14529 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CUX2O14529 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CUX2O14529 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CUX2O14529 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CUX2O14529 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CUX2O14529 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CUX2O14529 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CUX2O14529 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CUX2O14529 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.1 ms