Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POTEMA6NI47 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POTEMA6NI47 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms