Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VWA3AA6NCI4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VWA3AA6NCI4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms