Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB4Q9Y5E5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB4Q9Y5E5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms