Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMED7Q9Y3B3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMED7Q9Y3B3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMED7Q9Y3B3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMED7Q9Y3B3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMED7Q9Y3B3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TMED7Q9Y3B3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMED7Q9Y3B3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMED7Q9Y3B3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMED7Q9Y3B3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TMED7Q9Y3B3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMED7Q9Y3B3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMED7Q9Y3B3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TMED7Q9Y3B3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMED7Q9Y3B3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TMED7Q9Y3B3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms