Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEU3Q9UQ49 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEU3Q9UQ49 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms