Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNOT6Q9ULM6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNOT6Q9ULM6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms