Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH7Q9ULB5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH7Q9ULB5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms