Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
USP35Q9P2H5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP35Q9P2H5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP35Q9P2H5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms