Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP36Q9P275 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms