Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO1C1Q9NYB5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO1C1Q9NYB5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO1C1Q9NYB5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO1C1Q9NYB5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO1C1Q9NYB5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLCO1C1Q9NYB5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLCO1C1Q9NYB5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLCO1C1Q9NYB5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLCO1C1Q9NYB5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLCO1C1Q9NYB5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms