Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF38Q9NXL2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms