Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MED29Q9NX70 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MED29Q9NX70 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms