Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB20Q9NX57 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB20Q9NX57 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB20Q9NX57 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1067.4 ms