Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJC28Q9NX36 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms