Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RBM28Q9NW13 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBM28Q9NW13 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM28Q9NW13 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms