Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NLE1Q9NVX2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLE1Q9NVX2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NLE1Q9NVX2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NLE1Q9NVX2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
NLE1Q9NVX2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NLE1Q9NVX2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
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