Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNAJC17Q9NVM6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJC17Q9NVM6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJC17Q9NVM6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJC17Q9NVM6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJC17Q9NVM6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJC17Q9NVM6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJC17Q9NVM6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJC17Q9NVM6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJC17Q9NVM6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNAJC17Q9NVM6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC17Q9NVM6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC17Q9NVM6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC17Q9NVM6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC17Q9NVM6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC17Q9NVM6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC17Q9NVM6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC17Q9NVM6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC17Q9NVM6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC17Q9NVM6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC17Q9NVM6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC17Q9NVM6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNAJC17Q9NVM6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNAJC17Q9NVM6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms