Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB4Q9NTQ9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB4Q9NTQ9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms