Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF3Q9NR81 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF3Q9NR81 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms