Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIT2Q9NQR4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIT2Q9NQR4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms