Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
LHX9Q9NQ69 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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LHX9Q9NQ69 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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LHX9Q9NQ69 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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LHX9Q9NQ69 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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LHX9Q9NQ69 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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LHX9Q9NQ69 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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LHX9Q9NQ69 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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LHX9Q9NQ69 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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LHX9Q9NQ69 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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LHX9Q9NQ69 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LHX9Q9NQ69 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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