Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD8

UBE2T, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2TQ9NPD8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2TQ9NPD8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2TQ9NPD8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2TQ9NPD8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2TQ9NPD8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2TQ9NPD8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2TQ9NPD8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2TQ9NPD8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2TQ9NPD8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2TQ9NPD8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE2TQ9NPD8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE2TQ9NPD8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE2TQ9NPD8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2TQ9NPD8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms