Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSU72Q9NP77 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSU72Q9NP77 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms