Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP29Q9HBJ7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP29Q9HBJ7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP29Q9HBJ7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms