Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CLMPQ9H6B4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLMPQ9H6B4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms