Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TAF1DQ9H5J8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TAF1DQ9H5J8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms