Protein–RNA interactions for Protein: Q9H444

CHMP4B, Charged multivesicular body protein 4b, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BQ9H444 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CHMP4BQ9H444 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHMP4BQ9H444 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms