Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU9

2610524H06Rik, RIKEN cDNA 2610524H06, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610524H06RikQ9CZU9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610524H06RikQ9CZU9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610524H06RikQ9CZU9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610524H06RikQ9CZU9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610524H06RikQ9CZU9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
2610524H06RikQ9CZU9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
2610524H06RikQ9CZU9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
2610524H06RikQ9CZU9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610524H06RikQ9CZU9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms