Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PI4K2AQ9BTU6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PI4K2AQ9BTU6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms