Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF8Q9BRL6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF8Q9BRL6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF8Q9BRL6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms