Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPIFA3Q9BQP9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms