Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLF1Q9BQI6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms