Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP19Q99542 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP19Q99542 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms