Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAP1L3Q99457 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms