Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF3Q96PU9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms