Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRERF1Q96PN7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRERF1Q96PN7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms