Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC138Q96M89 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC138Q96M89 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms