Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX22Q96L94 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX22Q96L94 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms