Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK5RAP3Q96JB5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK5RAP3Q96JB5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms