Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPNQ96H22 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms