Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CALML4Q96GE6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALML4Q96GE6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms