Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GCC1Q96CN9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCC1Q96CN9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms