Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX13Q92968 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX13Q92968 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX13Q92968 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX13Q92968 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX13Q92968 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX13Q92968 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX13Q92968 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX13Q92968 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX13Q92968 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX13Q92968 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX13Q92968 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX13Q92968 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX13Q92968 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX13Q92968 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX13Q92968 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX13Q92968 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX13Q92968 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms